Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC37Q16543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC37Q16543 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC37Q16543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC37Q16543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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