Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKN1Q16512 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKN1Q16512 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKN1Q16512 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKN1Q16512 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKN1Q16512 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKN1Q16512 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKN1Q16512 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PKN1Q16512 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKN1Q16512 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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