Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPTX1Q15818 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms