Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB30Q15771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB30Q15771 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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