Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA2Q15560 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEA2Q15560 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms