Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIV2LQ15477 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIV2LQ15477 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIV2LQ15477 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms