Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEC23AQ15436 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC23AQ15436 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC23AQ15436 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
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