Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCP1Q15431 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP1Q15431 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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