Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR1Q15399 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR1Q15399 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR1Q15399 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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