Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN1Q15293 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN1Q15293 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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