Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD1Q15011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD1Q15011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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