Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPNMBQ14956 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GPNMBQ14956 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms