Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NFIXQ14938 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NFIXQ14938 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NFIXQ14938 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NFIXQ14938 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
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