Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP1BQ14684 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP1BQ14684 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP1BQ14684 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms