Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A6Q14031 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A6Q14031 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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