Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP5Q14008 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP5Q14008 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP5Q14008 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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