Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCINQ13939 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCINQ13939 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCINQ13939 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCINQ13939 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCINQ13939 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCINQ13939 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCINQ13939 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCINQ13939 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCINQ13939 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCINQ13939 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCINQ13939 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCINQ13939 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCINQ13939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCINQ13939 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCINQ13939 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCINQ13939 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCINQ13939 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCINQ13939 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCINQ13939 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCINQ13939 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCINQ13939 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCINQ13939 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCINQ13939 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCINQ13939 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCINQ13939 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCINQ13939 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCINQ13939 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCINQ13939 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCINQ13939 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCINQ13939 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCINQ13939 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCINQ13939 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCINQ13939 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCINQ13939 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCINQ13939 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCINQ13939 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCINQ13939 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCINQ13939 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCINQ13939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCINQ13939 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCINQ13939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCINQ13939 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCINQ13939 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCINQ13939 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCINQ13939 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms