Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRR1Q13601 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRR1Q13601 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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