Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSAMPQ13449 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSAMPQ13449 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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