Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT88Q13099 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT88Q13099 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT88Q13099 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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