Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKRN3Q13064 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MKRN3Q13064 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN3Q13064 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN3Q13064 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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