Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXC1Q12948 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXC1Q12948 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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