Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A2Q12908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC10A2Q12908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A2Q12908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A2Q12908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
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