Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIAQ12857 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFIAQ12857 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
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