Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPTFQ12830 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BPTFQ12830 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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