Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C1Q12789 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C1Q12789 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms