Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4BQ07343 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4BQ07343 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms