Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL16A1Q07092 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL16A1Q07092 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL16A1Q07092 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL16A1Q07092 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms