Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTK2Q05397 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms