Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELAQ04206 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELAQ04206 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELAQ04206 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELAQ04206 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELAQ04206 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELAQ04206 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELAQ04206 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELAQ04206 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RELAQ04206 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELAQ04206 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELAQ04206 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELAQ04206 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RELAQ04206 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RELAQ04206 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RELAQ04206 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELAQ04206 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELAQ04206 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELAQ04206 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELAQ04206 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELAQ04206 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELAQ04206 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELAQ04206 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELAQ04206 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELAQ04206 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELAQ04206 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RELAQ04206 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RELAQ04206 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RELAQ04206 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RELAQ04206 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RELAQ04206 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RELAQ04206 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RELAQ04206 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RELAQ04206 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RELAQ04206 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RELAQ04206 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RELAQ04206 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RELAQ04206 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RELAQ04206 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RELAQ04206 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RELAQ04206 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RELAQ04206 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RELAQ04206 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELAQ04206 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RELAQ04206 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RELAQ04206 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RELAQ04206 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RELAQ04206 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RELAQ04206 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RELAQ04206 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RELAQ04206 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELAQ04206 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms