Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG1Q02297 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRG1Q02297 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms