Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF17Q02223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF17Q02223 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms