Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROR1Q01973 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROR1Q01973 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROR1Q01973 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms