Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMP22Q01453 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMP22Q01453 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms