Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB2Q00653 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKB2Q00653 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms