Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTRA4P83105 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTRA4P83105 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms