Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEP78395 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEP78395 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms