Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2LP62875 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2LP62875 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2LP62875 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms