Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4XP62701 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms