Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1CBP62140 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1CBP62140 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1CBP62140 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms