Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP46P62068 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP46P62068 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP46P62068 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP46P62068 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP46P62068 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP46P62068 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP46P62068 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP46P62068 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP46P62068 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP46P62068 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP46P62068 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP46P62068 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP46P62068 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP46P62068 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP46P62068 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP46P62068 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP46P62068 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP46P62068 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP46P62068 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP46P62068 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP46P62068 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP46P62068 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP46P62068 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP46P62068 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP46P62068 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP46P62068 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP46P62068 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP46P62068 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP46P62068 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP46P62068 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP46P62068 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP46P62068 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP46P62068 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP46P62068 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP46P62068 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP46P62068 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP46P62068 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP46P62068 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP46P62068 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP46P62068 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP46P62068 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP46P62068 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP46P62068 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP46P62068 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP46P62068 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP46P62068 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP46P62068 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP46P62068 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP46P62068 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP46P62068 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP46P62068 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP46P62068 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP46P62068 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP46P62068 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP46P62068 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP46P62068 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms