Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOAP61586 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOAP61586 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOAP61586 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOAP61586 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOAP61586 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOAP61586 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOAP61586 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOAP61586 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOAP61586 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOAP61586 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOAP61586 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOAP61586 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOAP61586 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOAP61586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOAP61586 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOAP61586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOAP61586 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOAP61586 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOAP61586 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOAP61586 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOAP61586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOAP61586 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOAP61586 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOAP61586 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOAP61586 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOAP61586 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOAP61586 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOAP61586 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOAP61586 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOAP61586 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOAP61586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOAP61586 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOAP61586 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOAP61586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOAP61586 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOAP61586 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOAP61586 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOAP61586 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms