Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR3P61158 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR3P61158 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms