Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVFC1P60507 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVFC1P60507 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVFC1P60507 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms