Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX16P57768 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX16P57768 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX16P57768 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX16P57768 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX16P57768 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX16P57768 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX16P57768 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX16P57768 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX16P57768 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX16P57768 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX16P57768 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX16P57768 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX16P57768 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX16P57768 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX16P57768 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX16P57768 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX16P57768 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX16P57768 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX16P57768 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX16P57768 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX16P57768 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX16P57768 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX16P57768 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX16P57768 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX16P57768 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX16P57768 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX16P57768 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX16P57768 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX16P57768 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX16P57768 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX16P57768 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX16P57768 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX16P57768 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX16P57768 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX16P57768 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX16P57768 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX16P57768 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX16P57768 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX16P57768 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX16P57768 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX16P57768 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX16P57768 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX16P57768 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms