Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH11P55287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH11P55287 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH11P55287 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH11P55287 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH11P55287 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH11P55287 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH11P55287 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH11P55287 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH11P55287 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH11P55287 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH11P55287 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH11P55287 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH11P55287 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH11P55287 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH11P55287 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH11P55287 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH11P55287 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH11P55287 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH11P55287 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH11P55287 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH11P55287 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH11P55287 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH11P55287 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH11P55287 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH11P55287 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH11P55287 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH11P55287 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH11P55287 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH11P55287 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH11P55287 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH11P55287 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH11P55287 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH11P55287 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH11P55287 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH11P55287 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH11P55287 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH11P55287 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH11P55287 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH11P55287 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH11P55287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH11P55287 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH11P55287 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH11P55287 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH11P55287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms