Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEMP55040 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEMP55040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEMP55040 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEMP55040 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEMP55040 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GEMP55040 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GEMP55040 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMP55040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMP55040 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMP55040 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMP55040 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMP55040 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMP55040 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMP55040 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMP55040 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMP55040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMP55040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMP55040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMP55040 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMP55040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMP55040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMP55040 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMP55040 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMP55040 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMP55040 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMP55040 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMP55040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMP55040 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMP55040 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMP55040 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMP55040 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMP55040 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMP55040 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMP55040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMP55040 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMP55040 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMP55040 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMP55040 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMP55040 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMP55040 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMP55040 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMP55040 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMP55040 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMP55040 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMP55040 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMP55040 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMP55040 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMP55040 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMP55040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMP55040 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMP55040 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMP55040 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMP55040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GEMP55040 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GEMP55040 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GEMP55040 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms