Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHA4P54764 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA4P54764 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms