Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB4P54760 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB4P54760 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB4P54760 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB4P54760 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPHB4P54760 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB4P54760 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB4P54760 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EPHB4P54760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB4P54760 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EPHB4P54760 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB4P54760 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB4P54760 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB4P54760 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB4P54760 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms