Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RARSP54136 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RARSP54136 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RARSP54136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RARSP54136 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RARSP54136 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RARSP54136 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RARSP54136 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RARSP54136 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RARSP54136 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RARSP54136 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RARSP54136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RARSP54136 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RARSP54136 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RARSP54136 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RARSP54136 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RARSP54136 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RARSP54136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RARSP54136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RARSP54136 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RARSP54136 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RARSP54136 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RARSP54136 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RARSP54136 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RARSP54136 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RARSP54136 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RARSP54136 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RARSP54136 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RARSP54136 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RARSP54136 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RARSP54136 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RARSP54136 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RARSP54136 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RARSP54136 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RARSP54136 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RARSP54136 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RARSP54136 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RARSP54136 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RARSP54136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RARSP54136 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RARSP54136 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RARSP54136 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RARSP54136 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RARSP54136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RARSP54136 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RARSP54136 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RARSP54136 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RARSP54136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RARSP54136 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RARSP54136 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RARSP54136 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RARSP54136 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RARSP54136 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RARSP54136 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RARSP54136 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RARSP54136 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RARSP54136 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RARSP54136 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RARSP54136 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RARSP54136 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RARSP54136 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms